بهبود روش های یادگیری جمعی برای پیش بینی اهداف میکرو آر ان ای

پایان نامه
چکیده

میکروآران ای ها یک کلاس از آران ای های کوچک غیرکدشونده تنظیمی هستند که اهمیت بسیار زیادی در خاموش کردن ژن های پست-ترنسکریپشنال دارند. آن ها اکثراً با چسبیدن به بخش 3’utr( three prime untranslated region) مسنجر آران ای های هدف، میزان ژن ها را به یکی از دو روش بریدن یا مهار کردن تنظیم می کنند. دانشمندان در ابتدا اهداف میکرو آر ان ای ها را با انجام آزمایش مشخص می کردند. با این وجود، به خاطر پرهزینه و زمان بر بودن این آزمایش ها و نبود روش های آزمایشگاهی با کارائی بالا استفاده از تکنیک های محاسباتی برای پیش بینی اهداف میکرو آر ان ای ها اجتناب ناپذیر است. در این پژوهش یک روش جمعی با استفاده از الگوریتم rotation forest معرفی شد. اولین بهینه سازی استفاده از طبقه بندهای پایه متفاوت برای ساخت مدل جمعی میباشد. در دومین نوآوری، با استفاده از الگوریتم ژنتیک که از متداول ترین الگوریتم های بهینه سازی است مجموعه بهینه طبقه بندهای پایه از بین طبقه بندهای پایه مختلف انتخاب گردید. همزمان با انتخاب بهینه طبقه بندهای پایه، تعداد زیرمجموعه ویژگی که از پارامترهای مهم در الگوریتم rotation forest می باشد نیز بهینه گردید. نتایج نشان داد روش ارائه شده کارائی روش های مشابه قبلی را بهبود داده است.

منابع مشابه

پیش بینی مسنجر آر ان ای های هدف میکرو آر ان ای ها توسط شبکه های عصبی چندلایه پرسپترون

پیش بینی اهداف میکرو آر ان ای ها از اهمیت ویژه ای برخوردار است. توسعه روش های محاسباتی و متعاقبا صرفه جویی در هزینه و زمان پژوهش های آزمایشگاهی، تاثیر بسزایی در افزایش سرعت ساخت داروهای درمانی از جمله داروهای ضد سرطانی دارد. با توجه به اینکه زمان کمی از شناخت میکرو آر ان ای ها می گذرد، روند پژوهش ها در ابتدا کند بوده است. اما به مرور با شکل گیری دیتابیس های بیولوژیکی و درک اهمیت آنها دانشمندان ...

15 صفحه اول

اثر پارامتر حالت در بهبود پیش بینی مدل های الاستوپلاستیک برای خاک های دانه ای

در این مقاله اثر پارامتر حالت در بهبود پیش بینی مدل های الاستوپلاستیک نشان داده شده است . برای این کار یک مدل رفتاری الاستوپلاستیک سطح حدی از طریق وارد کردن مفاهیم مکانیک خاک بحرانی در فرمولبندی مدل اصلاح گردیده است . مدل اصلاح شده توانایی شبیه سازی رفتار نمونه های متراکم و شل ماسه در بارگذاری های زهکشی شده و زهکشی نشده تک سویه و سیکلیک را دارا است . اصلاح مدل از طریق وابسته سازی زاویه انتقال ف...

متن کامل

افزایش مقاومت توتون به برخی ویروس‌های گیاهی با خاموشی ژن رمز کننده آنزیم آر ان ا پلی‌مراز وابسته به آر ان ای 1*

بیان ژن رمز کننده آنزیمآر ان ا پلی‌مراز وابسته به آر ان ا 1 )(RDR1 بر اثر آلودگی گیاه میزبان به ویروس تحریک شده و به نظر می‌رسد در مقاومت گیاه میزبان به بعضی از ویروس‌ها دخالت دارد. در پژوهش حا...

متن کامل

اثر عامل حالت در بهبود پیش بینی رخداد نوار برشی در خاک های دانه ای

در نظر گرفتن اثر حالت خاک، توانمنJدی مدل های رفتاری در شبیه سازی رفتار خاک های دانه ای را به گونه قابل توجهی افزایش می دهد. در این پژوهش نشان داده شده است که با در نظر گرفتن اثر حالت خاک در فرمول بندی مدل های رفتاری، می توان رخداد ناپایداری های داخلی از نوع نوار برشی را نیز با دقت بهتری پیش بینی نمود. به این منظور نخست فرمول بندی یک مدل رفتاری تابع حالت خاک شرح داده شده است. در ادامه نخست شرایط...

متن کامل

اثر عامل حالت در بهبود پیش بینی رخداد نوار برشی در خاک های دانه ای

The capability of sand constitutive models is remarkably improved by taking into account the effect of soil state in their formulations. In this study, it has been shown that considering the effect of soil state leads to better simulation of soil instability of shear banding type. To this aim, constitutive equations of a state dependent sand model are explained first. Consequently, the general ...

متن کامل

اثر پارامتر حالت در بهبود پیش بینی مدل های الاستوپلاستیک برای خاک های دانه ای

در این مقاله اثر پارامتر حالت در بهبود پیش بینی مدل های الاستوپلاستیک نشان داده شده است . برای این کار یک مدل رفتاری الاستوپلاستیک سطح حدی از طریق وارد کردن مفاهیم مکانیک خاک بحرانی در فرمولبندی مدل اصلاح گردیده است . مدل اصلاح شده توانایی شبیه سازی رفتار نمونه های متراکم و شل ماسه در بارگذاری های زهکشی شده و زهکشی نشده تک سویه و سیکلیک را دارا است . اصلاح مدل از طریق وابسته سازی زاویه انتقال ف...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی کرمان - دانشکده برق و کامپیوتر

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023